夏休み初日、ハンドボール部でチームメイトとぶつかり部活に居場所をなくした中学生の琉花は、父が働く水族館で、ジュゴンに育てられたという少年・海と空に出会う。同じ頃、世界各地の海や水族館から魚が姿を消し、海では謎の光が目撃されるなどの異変が起き始める。二人に惹かれていく琉花は、海の生き物たちが集まる「祭り」に巻き込まれていく。